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2005年10月4日,經國家科技部批准,香港大學兩間國家重點實驗室,夥伴實驗室開幕,是境外首次亦是香港首批國家重點實驗室。

其中「新發傳染性疾病實驗室」重點研究禽流感、沙士等傳染病。「腦與認知科學實驗室」研究項目包括讀寫障礙、自閉症等。科技部先後與本港多間大學合作,共設立16間國家重點實驗室,及6間國家工程技術研究中心香港分中心。

科技部部長萬鋼,2015年來港主持授牌儀式,及表揚各單位的貢獻。港區全國人大代表黃玉山:「其實這些重點實驗室的成立,之前反映內地相關科學家,與香港不同院校已經有科研合作,有些項目已經進行,而且取得很好的成績,因此將這些項目發展成不同的國家重點實驗室。」

2004年粵港推出的「粵港科技合作資助計劃」,鼓勵兩地大學,科研機構和企業加強合作。截至今年10月,共有逾300個核准項目,資助金額超過9億元。